dr hab. Dorota Krzyżanowska współautorką artykułu opublikowanego w prestiżowym Nature Microbiology
Mamy przyjemność poinformować, że dr hab. Dorota Krzyżanowska z Zakładu Badania Związków Biologicznie Czynnych została współautorką artykułu opublikowanego w prestiżowym czasopiśmie Nature Microbiology (doi: 10.1038/s41564-024-01833-4). Artykuł pt.: „Community standards and future opportunities for synthetic communities in plant–microbiota research” przedstawia najnowsze wytyczne i standardy dla badań nad tzw. syntetycznymi społecznościami mikroorganizmów (SynComs). Publikacja jest wynikiem twórczej dyskusji przeprowadzonej w międzynarodowym gronie naukowców.
Rośliny rozwijają się w obecności złożonych społeczności mikroorganizmów już od ponad 500 milionów lat. Mikroorganizmy te pełnią wiele korzystnych funkcji, takich jak mobilizacja składników odżywczych czy ochrona przed patogenami. SynComs, czyli uproszczone społeczności mikroorganizmów, pozwalają badać te interakcje w kontrolowanych warunkach, co umożliwia odkrywanie mechanizmów wspierających wzrost i zdrowie roślin.
Jak wskazują autorzy, badania nad SynComs wiążą się jednak z licznymi wyzwaniami. Kluczowym problemem jest brak jednolitych standardów co do projektowania i stosowania SynComs, co utrudnia powtarzalność wyników i porównywalność badań między laboratoriami. Kolejną trudnością jest znalezienie odpowiedniego balansu między uproszczeniem a odwzorowaniem naturalnej złożoności mikrobiomów roślinnych – uproszczone SynComs ułatwiają kontrolę eksperymentów, ale mogą nie odzwierciedlać pełnej różnorodności i funkcji naturalnych mikroorganizmów. Na poziomie technicznym wyzwaniem jest także zapewnienie czystości kultur mikroorganizmów oraz zarządzanie olbrzymimi zbiorami danych biologicznych, często powstającymi w toku takich badań.
W odpowiedzi na te problemy autorzy artykułu zalecają utworzenie referencyjnych SynComs, standaryzację procedur badawczych oraz rozwój infrastruktury do dzielenia się wynikami i szczepami drobnoustrojów. Inicjatywy te mogą przyczynić się do rozwoju bardziej odpornych roślin, co jest kluczowe dla bezpieczeństwa żywnościowego i przeciwdziałania zmianom klimatycznym, otwierając nowe perspektywy dla ekologii mechanistycznej i zrównoważonego rolnictwa.
**Dr Dorota Krzyżanowska pragnie podziękować fundacji Novo Nordisk za finansowe i organizacyjne wsparcie, które umożliwiło spotkanie współautorów i tym samym odegrało istotną rolę w powstaniu tej publikacji. Specjalne podziękowania kieruje również do autorów korespondencyjnych: Trenta R. Northen (Environmental Genomics and Systems Biology Division, DOE Joint Genome Institute, Berkeley, CA, USA) i Rubena Garrido-Oter (Max Planck Institute for Plant Breeding Research, Cologne, Germany).**